Išsamus biožymenų raiškos intranavikinio heterogeniškumo įvertinimas skaitmeninės imunohistochemijos vaizdo analizės būdu

Projekto įgyvendinimo laikotarpis: 2013-05-02-2015-11-30 (31 mėnesis)

Finansavimas: Europos Sąjungos Socialinis fondas, 2007-2013 m. Žmogiškųjų išteklių plėtros veiksmų programos 3 prioriteto „Tyrėjų gebėjimų stiprinimas“ priemonė VP1-3.1-ŠMM-07-K „Parama mokslininkų ir kitų tyrėjų mokslinei veiklai (visuotinė dotacija)“.

Įgyvendinantis personalas: Prof.  dr. Arvydas Laurinavičius, projekto vadovas, Prof. Ian Ellis, vyriausiasis mokslo darbuotojas, Dr. Paulette Herlin, vyriausioji mokslo darbuotoja, Dr. Aida Laurinavičienė, mokslo darbuotoja, Raimundas Meškauskas, jaunesnysis mokslo darbuotojas, Justinas Besusparis, jaunesnysis mokslo darbuotojas, Indra Baltrušaitytė, jaunesnioji mokslo darbuotoja, Yasir Iqbal, specialistas programuotojas.

Projekto tikslas: Sukurti ir išbandyti vėžio audinio heterogeniškumo tyrimo metodologijas, siekiant išsamaus IHC biožymenų raiškos nustatymo.

Projekto uždavinys: Įvertinti alternatyvius matematinius principus geriausiai vėžio audinio heterogeniškumo nustatymo strategijai įgyvendinti ir atlikti išsamią krūties vėžio IHC žymenų skaitmeninę analizę su validuotais heterogeniškumo parametrais.

Molekuliniai vėžio tyrimai atskleidė reikšmingą intranavikinę ląstelių populiacijų įvairovę. Be jos įvertinimo negalima sukurti patikimų vėžio prognostinių/prediktyvinių žymenų sistemų, reikalingų individualizuotai terapijai. Imunohistocheminiai (IHC) žymenys plačiai taikomi vėžio patologijos tyrimuose ir leidžia analizuoti erdvinius intranavikinės jų raiškos aspektus, tačiau jų vizualus pusiau kiekybinis vertinimas nėra pakankamas pokyčiams objektyvizuoti. Vis plačiau taikomos skaitmeninės analizės sistemos, įgalinančios tikslesnį ir kiekybinį, tačiau kol kas paskelbti tik pavieniai bandymai įvertinti ir erdvinį žymenų raiškos pasiskirstymą naviko audinyje. Siūloma sukurti ir pritaikyti metodologiją ląstelių IHC heterogeniškumui vėžio audinyje įvertinti. Metodologijos pagrindu bus sukurta ir validuota programinė įranga bei procedūros išsamiam skaitmeniniam IHC įvertinimui, apimančiam kiekybinius ir erdvinius IHC raiškos aspektus. Metodologijai kurti bus taikomi alternatyvūs ir vienas kitą papildantys vaizdo tekstūros ir stereologijos matematiniai principai, leidžiantys aptikti ir pamatuoti erdvinius įvykių netolygumus. Atrinkti metodai bus optimizuoti ir validuoti. Sukurta metodologija ir įrankiai bus pritaikyti daugiacentrinei (Vilnius, Caen, Nottingham) krūties vėžio IHC skaitmeninei analizei ir ligos prognostinių modelių tobulinimui, papildant juos audinio heterogeniškumo aspektus. Tyrimo rezultatai leis geriau suprasti ligos biologiją ir kurti klinikinių sprendimų palaikymo sistemas.

Apie mus rašo: 2015 12 17 Vėžio žymenų tyrimams - inovacija, įkvėpta gamtos